衝突被定義為“在矛盾的或對立的人、概念或利益之間不和諧的狀態。”從心理學角度看，當世界的不同表象相互對立或排斥時衝突是一個心智鬥爭，並且有時是潛意識的、為結果而產生的。衝突既可以是我們自己內在各部分之間的衝突（內在衝突），也可以是外在的、與他人之間的衝突（人際衝突）。
衝突內在的出現在人類經驗的不同部分之間，並且會在多個層次上出現。例如，可能出現關於行為的衝突。一個人一方面想看某個電視節目，另一方面又想出去運動。衝突還可能出現在不同的能力之間——如，創造力和保護之間。人還可能有信念衝突和價值觀衝突。某人可能一方面相信自己適合學習數學，另一方面又不相信自己能夠學會。這就會產生學習數學的困境。自我認同層次的衝突通常與角色有關。一方面，某人作為父母可能體驗到責任之間的困境；另一方面，他作為一個專家也可能體驗到責任之間的困境。
在人與人之間，人們的不同真實地圖有時形形色色，以至於當他們試圖相互溝通或互動時會出現“碰撞”。關於世界的基本假設、信念、價值觀和假設前提聚集到一起，產生了不同的真實模式。如果這些模式或地圖不含有機制，使人創造性的回應與其他地圖的“碰撞”，能量就會以爭論、爭端、鬥爭等形式釋放出來。談判、調解和仲裁都是管理人際衝突的形式。
NLP為處理和解決內在衝突和外在衝突提供了很多技巧和工具，包括重新架構技巧，衝突整合，轉換感知位置以及很多基本的溝通技巧，如轉換模式，測度以及非言語溝通方法。
下面對處理衝突的基本NLP方法進行概述。
- 清楚的找出衝突的關鍵問題。這些問題可以作為相反的事物或對立被表達出來。確定他們最集中於衝突的哪一個邏輯層次。
如，投資或花錢對省錢＝行為層次的衝突 - 建立一個無偏見的“轉換位置”，它清楚的從衝突的任何一方相區別。
- 找出每方問題背後的正向意圖和目的。正向意圖的層次必需比產生衝突的問題的層次更高。（“你不可能在產生問題的思考層次解決問題。”）正向意圖不會是相反或對立的，它們更多時候是互補的、相互受益的而非獨立的。
如，花錢＝“成長”；省錢＝“安全” - 確認每方都找出並承認另一方的正向意圖。這並不意味著每方都必需接受另一方試圖滿足正向意圖所使用的方法，也不意味著每方都必需讓出自己的位置。
- 從“轉換位置”一直“向上歸類”直到找出雙方都能分享的、處於更高層次的共同意圖。
- 探索獲得共同意圖的其他選擇，而不是產生衝突的兩個選擇。這可能包括混合兩個現存選擇，但也應該至少包括一個與衝突中的兩個選擇完全不同的選擇。
如，投資，省錢，借錢，創造一個選擇性收入通道，找一個投資夥伴，減少花費，這樣錢就能投入其他領域，等等。 - 找出選擇或多個選擇的結合，它們最有效、最生態的滿足了共同意圖和含有最大正向衝擊系統性的個人正向意圖。
